Il protocollo prevede un=ispezione delle serre di coltivazione circa 10 gg prima della commercializzazione delle piante, al fine di rilevare la presenza di fitofagi e piante con sintomi di malattia; in occasione di tale sopralluogo viene effettuato un campionamento di materiale sintomatico e/o asintomatico che sarà successivamente sottoposto ad analisi di laboratorio;

Il campionamento è realizzato costituendo 1 campione ogni 100.000 piante di una stessa varietà, prelevando circa 20 piante in punti diversi della superficie investita; per varietà con meno di 100.000 piante, sarà comunque considerato almeno un campione;

Sia l'ispezione che il campionamento sono eseguite da tecnici del laboratorio accreditato;

Le analisi virologiche sono effettuate mediante tests immuno-enzimatici nella versione diretta (DAS-Elisa) o indiretta (TAS-Elisa) e sono volte alla ricerca dei principali virus che interessano le ortive (vedi Tabella).

In assenza di patologie, il laboratorio emette un certificato di analisi attestante la data dell'ispezione, la denominazione del campione, i patogeni ricercati, la metodica diagnostica utilizzata e l'esito delle analisi.

In presenza di alterazioni sulle piante verranno effettuati opportuni accertamenti per individuarne l'origine e le modalità di eradicazione.